Brøndby U21 är ett danskt fotbollslag som spelar i U21 Divisionen, den högsta ligan för U21-lag i Danmark. Laget är ungdomsakademin för Brøndby IF, ett av de mest framgångsrika klubbarna i dansk fotbollshistoria.

Brøndby U21 har vunnit U21 Divisionen tre gånger, senast 2019. Laget har också representerat Danmark i UEFA Youth League vid flera tillfällen.

Några av de mest kända spelarna som har spelat för Brøndby U21 inkluderar Simon Kjær, Andreas Christensen och Christian Eriksen.

Lagets nuvarande huvudtränare är Martin Retov.