Auxerre II är ett franskt fotbollslag från staden Auxerre i Bourgogne-Franche-Comté-regionen. Det är reservlaget till Ligue 1-klubben AJ Auxerre och spelar för närvarande i Championnat National 2, som är den fjärde divisionen i det franska fotbollssystemet.

Auxerre II grundades 1969 och har sedan dess tjänat som en plantskola för unga talanger i klubben. Laget har vunnit Championnat de France Amateur (CFA), den dåvarande fjärde divisionen, två gånger, 1996 och 2012.

Några av de mest anmärkningsvärda spelarna som har spelat för Auxerre II är Djibril Cissé, Olivier Kapo och Patrice Evra.